En menor medida se encuentra ya a la agricultura, y a las factorias, tanto del municipio como de municipios lindantes; como ejemplo de fabrica en este municipio, mas concretamente en la Penilla de Cayón, tenemos a la Nestle, en la cual trabajan un gran numero de habitantes del valle.

Los primeros vestigios arqueológicos que nos pueden confirmar la existencia de pobladores en esta zona, se reducen a algunos hallazgos aislados localizados fuera de contexto. Entre ellos destacar la existencia de un hacha pulimentada sin adscripción cronológica concreta. Las primeras referencias documentales se refieren a la Alta Edad Media, concretamente a los primeros años del siglo VIII, cuando la llegada de gentes de Castilla, favorecida por los planes Repobladores de Alfonso I, pobló la mayor parte de las tierras de la actual Cantabria.
En el 811, aparece documentado el monasterio de San Vicente de Fístoles, de tipo dúplice, lo que confirma un poblamiento anterior. En el 816, el conde Gumersindo dona a San Vicente propiedades que llegan hasta el mar, y enumera algunas iglesias de Arce, Velo, Oruña, Liencres, Mortera, "Val de Cayón" (quizás Santa María de Cayón), Sobarzo, Liérganes, etc.
En el siglo XI, algunas iglesias, como Santa María de Cayón y San Cipriano de Esles, aparecen vinculadas al monasterio santanderino de San Emeterio. Dada la proximidad al poderoso monasterio de Castañeda, es seguro que en este mismo siglo, parte de los territorios del valle estarían vinculados a este señorío de abadengo. El hecho parecen confirmarlo las semejanzas entre la colegiata de Castañeda y las de Santa María y Argomilla de Cayón.

Con la Baja Edad Media, se debilitan los señoríos de abadengo, para surgir con gran fuerza los nobiliares. Los habitantes de este valle eran de behetría y estaban vinculados a los linajes locales de los Obregón y Ceballos. Alfonso XI de Castilla, en el siglo XIV, vincula el territorio a Gonzalo Ruiz de la Vega, del linaje de la Vega. La cesión será confirmada por Juan II en la persona del Marqués de Santillana.
La inclusión de esta tierra, tradicionalmente de behetría, en el señorío Mendoza-de la Vega, provocará un fuerte conflicto que desembocará en el Viejo Pleito y luego en el Pleito de los Valles, por el que se reclama la recuperación de su condición de realengo. La sentencia será favorable a los habitantes de Cayón en 1581.
A partir de entonces, el territorio se integra en la provincia de los Nueve Valles, que en el siglo XVIII, dará lugar a la provincia de Cantabria.

Entre el patrimonio artístico del Municipio, destacar dos bellos ejemplos románicos. Santa María de Cayón y San Andrés de Argomilla, como ya dijimos, de gran semejanza con la colegiata de Castañeda. Santa María se empezó a construir hacia mediados del siglo XII.
Es un edifico bastante reformado, con portada de cinco arquivoltas lisas, de medio punto; nave de crucero muy alta; ábside, y presbiterio que parece algo posterior debido a la utilización de arcos apuntados.
San Andrés de Argomilla se construyó en los mismos años, igualmente, de una nave y un ábside, y con capiteles labrados semejantes a los de Castañeda. Posee sarcófagos de los siglos XI al XIII. San Miguel de Carceña, cerca de La Penilla, es una ermita de transición, más próxima a lo protogótico que a lo románico.

Otras iglesias de interés, ya del XVI-XVII, son: La de San Esteban, en Abadilla; la de la Encina; la de Esles, la de Lloreda; la de la Magdalena, en la Penilla, etc. La arquitectura nobiliar cuenta con bellos ejemplares de casonas de los siglos XVII y XVIII, como la de Ceballos el Caballero, en Argomilla, con cubos angulares almenados (quizás del XVI); la de Obregón, en la Abadilla; la de Córdoba, "Solatorre", Gutiérrez de la Concha, en Esles; Ruiz de Obregón, en Lloreda, etc. Del siglo XX, destacar la casa regionalista de Marcial Solana,en Esles.